Hra je vyvíjaná v tajnej laboratóriu nachádzajúce sa na dne oceánu. Tu v osamelosti žil excentrického vedca, skúsenosti a experimenty kolegovia mu vyčítať. Jeho hlavnou úlohou bolo vytvoriť živá bytosť obdarení rozumom a roky neskôr to urobil. Ale zároveň tvorca zmizla za záhadných okolností, takže Goo (toto meno dostal jeho potomkov) a čakať, až chýbať. Hrdina unavený visí v banke fotoaparátu a dostať sa z toho, išiel na prehliadku areálu nájsť stopy chýbajúce priateľa. Schopnosť zvoliť mieru pružnosti pomôže prekonať rôzne prekážky, vyrovnať sa s nepriateľom a preniknúť k miestu, kde obyčajný človek, alebo ako sa dostať.